Para llevar a cabo importantes eventos académicos, congresos, ateneos, encuentros científicos y actividades docentes conjuntamente con universidades nacionales y extranjeras, la Fundación Sanatorio Güemes (que ocupa los pisos 20 y 21 de la torre principal del Sanatorio Güemes) cuenta con un Auditorio con capacidad para 160 personas equipado con la más alta tecnología, de audio y video para transmitir conferencias en aulas virtuales de todo el país.
Asimismo cuenta con 7 aulas totalmente equipadas en el 2º subsuelo del edificio con capacidad para 120 alumnos.